2006年12月18日，蒙牛宣布与达能成立合资公司，据协议，蒙牛与达能将共同出资在内蒙古、北京和马鞍山成立酸奶合资公司。三家合资公司的框架相同：蒙牛以厂房、设备及无形资产出资，占合资公司51%的股权；达能以现金出资占49%。
其时正值达能娃哈哈股权之争，外界对蒙牛达能股权关系结构颇有微词，牛根生公开在个人博客发表声明，目前与法国达能的合作仅限于酸奶一类。按照蒙牛集团公布的2006年度业绩，酸奶销售收入仅占蒙牛集团总收入的6.4%。在此领域，双方拟新设三家合资公司，均由蒙牛集团持股51%，达能持股49%。据此计算，达能所持合资公司的股份辐射的业务量仅占蒙牛集团总业务量的3.1%。
2007年12月，蒙牛宣布结束与达能刚满一年的合作，原因始终未公开。
2007年，达能亚太区的销售增长从2006年的20.6%迅速萎缩为4.8%，达能全年纯利增长由2006年的15.8%缩水为2007年的-0.75%。
2008年10月，因涉入三聚氰胺事件，蒙牛销售额急转直下，牛根生有一批股份被抵押在摩根士丹利，但因股价暴跌，为避免被外资收购，需要及时补足保证金，牛根生发表“万言书”，求援柳传志、马云等企业家保卫民族品牌蒙牛。
2009年7月5日，牛根生将实际控制的近10%的蒙牛股份，以17.6元的价格配售给中粮和厚朴基金，兑现了未将民族品牌出让给外资的承诺。
这笔61亿港元投资，中粮通过合资目标公司，持有蒙牛20.03%的股份，之后中粮又数次增资，共持有蒙牛28.09%股权，成为第一大实际控制人。并对蒙牛创始人团队做出“三年不干政”承诺。
2012年4月12日欧世蒙牛奶粉最新事件，蒙牛乳业发布公告，总裁杨文俊两届任期已满，不再兼任总裁一职，继续担任副董事长职务，总裁一职由中粮地产原副总经理孙伊萍接任。
蒙牛正式进入中粮时代。
三年来，蒙牛交给中粮业绩为：营收从257.1亿元增至373.87亿元，净利由11.1亿元增至15.89亿元。
2012年6月15日，蒙牛与欧洲乳业巨头爱氏晨曦（Arla Foods）在丹麦首都哥本哈根签署了战略合作协议。随后，蒙牛、爱氏晨曦及中粮集团共同签署了一系列协议，爱氏晨曦以22亿港元入股蒙牛，持股约5.9%，成为蒙牛继中粮之后的第二大战略股东。
2013年，雅士利投资了2.2亿纽币(约合11亿元人民币)在新西兰建设奶粉生产基地欧世蒙牛奶粉最新事件，设计年产量52000吨婴幼儿配方奶粉，婴幼儿配方奶粉罐装线可达每分钟120罐的罐装能力，奶粉生产线水准居世界领先水平。
2013年5月20日，中粮集团与法国达能签署协议，中粮和达能将合作成立一家合资公司，中粮同意向该合资公司转让中国蒙牛股份。新成立的合资公司中粮将占股51%，达能占股49%。转股交易完成后，中粮仍是蒙牛乳业的最大单一股东。达能通过合资公司在蒙牛乳业的首期持股约为4%，成为蒙牛第三大战略股东，并计划将来根据市场进展增持蒙牛的股份。与此同时，蒙牛乳业和达能签署了框架协议，达能中国的酸奶业务将与蒙牛酸奶业务合并，双方将组建新的合资公司专项从事酸奶生产及销售业务。蒙牛达能二次握手。
2013年5月31日，国务院召开常务会议，提出按照药品管理办法监管婴幼儿奶粉质量，即GMP改造。工信部发布《提高乳粉质量水平 提振社会消费信心行动方案》，这份被简称为“双提”的行动方案，第一步行动就是从6月到8月，针对婴幼儿乳粉企业进行质量安全检查。
2013年6月18日，蒙牛乳业与雅士利联合宣布，蒙牛乳业向雅士利所有股东发出要约收购，并获得控股股东和第二大股东接受要约的承诺，承诺出售合计约75.3%的股权。此次交易的最大现金量将超过124亿港元(约合人民币98亿元)，同时，也是迄今为止中国乳业最大规模的一次并购。
2013年8月，达能于2007年收购的多美滋因供应商恒天然肉毒杆菌乌龙事件迅速从高峰跌落谷底。多美滋中国销售额从2012年的56.83亿元人民币降至2014年的13.19亿元人民币，同期净利则由盈利7.92亿元转为亏损7.71亿元。
2013年12月，多美滋中国总经理卢敏放升任达能纽迪希亚大中华区副总裁。
2014年2月12日，达能增持蒙牛，所持股权由原来的4%提升到9.9%，成为蒙牛第二大股东。
2014年10月，蒙牛、达能与雅士利签署协议，宣布在婴幼儿奶粉领域开展三方合作。达能亚洲以现金43.9亿元认购约25%股份，成为雅士利第二大股东。
2014年12月30日，雅士利董事局收到达能亚洲就委任卢敏放为总裁而发出的推荐函件。 雅士利董事会公告，张利钿将不再担任行政总裁并将调任为公司的非执行董事及董事会副主席，自2015年1月7日起生效。张利钿将继续担任公司的薪酬委员会成员；卢敏放将获委任为总裁，自2015年1月7日起生效。
2015年9月21日，蒙牛与雅士利联合宣布，雅士利与蒙牛签订了一项股权转让协议，蒙牛决定将旗下欧世蒙牛的全部股权，以10.5亿元价格转让给雅士利，至此，雅士利成为蒙牛所有奶粉业务的承载平台。
2015年11月，蒙牛旗下雅士利新西兰工厂正式投产，原产原装的第一批海外版奶粉在新西兰部分超市上架。
2016年3月21日，达能纽迪希亚中国旗下品牌可瑞康官方微博发布公告称，纽迪希亚中国官方进口的新西兰可瑞康金装系列在中国暂停销售。可瑞康金装是纽迪希亚旗下拥有的优质产品系列之一，新西兰当地市场仍继续有售。 公告称，纽迪希亚中国将专注于诺优能和爱他美等品牌在中国市场的发展。
2016年4月，蒙牛雅士利宣布新西兰原装国行婴幼儿配方奶粉进入中国市场，该行动被蒙牛总裁孙伊萍定义为“新国货”。
2016年5月2日，雅士利国际发布公告，拟出资1.5亿欧元（约11.2亿人民币）从达能手中收购多美滋中国全部股权。其时多美滋销售额已自2012财年的56.83亿元，降至2015财年的4.17亿元，降幅达92.66%；净利则从2012财年的7.92亿元降至2015财年的亏损8.39亿元，降幅200%。达能将出售多美滋的资金用来增持约2%蒙牛股份至11.9%。
2016年8月，雅士利公布，附属新西兰乳业与达能 NZ订立供应协议，新西兰乳业同意销售80万纽币乳清粉。之后再次宣布将向达能 NZ供应婴幼儿奶粉基粉，合同总额1870万元。
2016年8月24日，蒙牛发布财报显示，上半年实现营业收入272.6亿元，同比增长6.6%；净利润10.77亿元，同比下滑19.5%。对于净利润的下滑，蒙牛公开解释称，是受雅士利拖累。
2016年8月25日，雅士利国际在香港发布2016年中报。2016年上半年营收11.47亿元，同比下滑21.7%；归属于上市公司股东净利润1510万元，同比下滑86.2%。其中施恩品牌营收约人民币5920万元，Arla品牌营收约人民币6770万元，欧世蒙牛品牌收入约1.627亿元，多美滋品牌并购完成开始发力。
2016年9月15日，蒙牛乳业发布公告，孙伊萍已辞任公司执行董事、总裁及战略及发展委员会成员。由雅士利总裁接任蒙牛乳业总裁。
2016年9月19日，蒙牛乳业召开投资者电话会议，蒙牛乳业董事会主席马建平，新任总裁卢敏放参加会议。针对蒙牛下一步总体发展，卢敏放发言称：一是聚焦资源整合，全面提升运营效率、利润率；二是聚焦乳业在常温、低温、奶粉，要快速的增长；三是充分优化产业布局、调整奶源结构、解决历史问题，严把质量关，产品上下游形成合力，销售形成合力。四是处理好政府和相关企业合作关系、与经销商的关系，获得政府部门政策支持，发展蒙牛。
卢敏放在发言中也指出，蒙牛和主要竞争对手的差距在拉大，寻找和竞争对手的差距的原因将会是他在接下来战略中突出的重点。他说，接下来蒙牛的目标是产品创新、提升运营效率、持续改进渠道模式、提升盈利能力。
蒙牛正式进入达能时代。
